Den blå terning i Cube Runner vil overvinde forhindringer på vej til målstregen, og din opgave er at forhindre den i at kollidere med den røde terning - dette er dens mest forfærdelige fjende. Kontakt med det vil sparke dig ud af niveauet. De resterende blokke kan flyttes, og med deres hjælp kan du fjerne fjenden fra vejen.